El período de la dictadura militar marcó la sociedad chilena, sus instituciones y comportamientos políticos. La Concertación de Partidos por la Democracia, la coalición que gobernó Chile desde 1990 hasta 2010, se propuso esclarecer la verdad y restablecer la justicia en materia de derechos humanos. En 1990 creó a la Comisión Nacional de Verdad y Reconciliación, que el 4 de marzo de 1991 publicó un informe sobre la investigación de los crímenes y las violaciones de derechos humanos cometidas durante la dictadura, conocido como Rettig, debido a que la investigación estuvo dirigida por el profesor Raúl Rettig. Posteriormente, la Comisión sobre Prisión, Política y Tortura continuó el trabajo de investigación, esta vez dirigida por monseñor Sergio Valech, y presentó el informe conocido como Valech. Ambas comisiones recomendaron la construcción de memoriales y sitios de memoria para dignificar a las víctimas.

En Chile, la recuperación y conservación de los espacios donde se cometieron graves violaciones de los derechos humanos han sido efectuadas principalmente por iniciativa de la sociedad civil. De los 1.132 sitios de memoria identificados por el Informe Valech, 40 cuentan con una protección legal del Consejo de Monumentos Nacionales, 17 fueron recuperados como sitios de memoria por las organizaciones de derechos humanos y 13 están habilitados y abiertos al público.

El gobierno de Michelle Bachelet (2006-2010 y 2014-2018) instauró políticas de memoria y de reparación de los crímenes cometidos durante la dictadura militar. El Museo de la Memoria y los Derechos Humanos fue inaugurado en 2010 como una de las iniciativas de reparación simbólica. El sitio fue ideado para exhibir en forma permanente testimonios de la represión ejercida por la dictadura militar, con el fin de conservar la memoria sobre los hechos violentos perpetrados. Para la construcción del edificio se realizó un concurso con convocatoria internacional, en el que fue seleccionada la oficina brasileña Estudio América, que construyó un moderno recinto de 5.000 metros cuadrados.

El museo cuenta con testimonios orales y escritos, documentos jurídicos, cartas, relatos, producción literaria, material de prensa, largometrajes y fotografías documentales que ofrecen una reconstrucción cronológica de los diecisiete años de la dictadura militar. Las exposiciones abarcan temas como el golpe de Estado, el plan sistemático de represión, la resistencia, el exilio, la solidaridad internacional y el proceso de transición hacia la democracia. Además, se ofrecen muestras temporales, talleres, conferencias, ciclos de teatro y cine, y diversas actividades de educación y formación en derechos humanos.  En el sitio se resguardan los archivos de la Comisión de Verdad y Reconciliación y de la Comisión sobre Prisión, Política y Tortura. Además, el Centro de Documentación del Museo ofrece una Biblioteca Digital en donde el público puede acceder a las colecciones de los documentos que están digitalizados.

El Museo también cuenta con la exposición “Secretos de Estado. La historia desclasificada de la dictadura chilena”, una investigación sobre el vínculo que tuvieron los Estados Unidos con la dictadura militar. En la muestra se exhiben documentos y memorandos que fueron proporcionados por el Archivo de Seguridad Nacional y el Departamento de Estado estadounidense.